این تحقیق به منظور بررسی کیفیت و کمییت آب رودخانه زاینده رود در سرشاخه اصلی آن واقع در ایستگاه قلعه شاهرخ صورت گرفته است. موقعیت این رودخانه در مرکز فلات ایران اهمیت این رودخانه را بیش از پیش کرده است. ایستگاه قلعه شاهرخ واقع در ابتدای رودخانه و تامین کننده بخش عظیمی از آب این رودخانه میباشد. در ابتدا تغییرات خشکسالی در طول دوره آماری 40 ساله (1353-1393) توسط دو نمايهSPI و RDI بررسی گردید سپس در دورههای خشکسالی و تر سالی به وقوع پیوسته تغییررات کمی و کیفی آب رودخانه زاینده رود در ایستگاه قلعه شاهرخ بررسی گردید نتايج حاصل از مقايسه شاخص RDI با ميزان آبدهي حوزه، عدم همبستگي قطعي شاخص¬هاي خشكسالي و ميزان آبدهي را نشان ميدهد . به طوری که حداکثر میزان شاخص های SPI و RDI مربوط به سال 1385 و حداقل آن در سال 1387 و حداکثرمیزان دبی آب رودخانه در سال آبی71-70 اتفاق افتاده است. در 1359 همزمان با وقوع خشکسالی تقریبا غلطت تمامی یون ها افزایش یافته است. همچنین بررسی تغییرات پارامتر کیفی آب نشان می دهد در سال مرطوب غلظت سدیم 4/24 درصد و غلظت SAR 7/27 افزایش و غلظت پتاسیم 4/72 درصد و غلظت سولفات 5/16 درصد کاهش داشته است. هدف از انجام این تحقیق اعمال مدیریت صحیح منابع آبی می باشد.