زیره سبز (Cuminum cyminum L.) گیاهی است دارویی از خانواده چتریان (Apiaceae) که به دلیل وجود ترکیباتی مانند کومین آلدئید، سیمن، ترپنوئید و فلاونوئیدها، توجه زیادی را از نظر ارزش دارویی و فعالیت فارماکولوژیکی ( به عنوان فعالیت آنتی¬اکسیدانی، ضد باکتری و ضد سرطان و..) به خود جلب کرده است. فلاون¬ها زيرگروهي از فلاونوئيدها هستند که در مسير بيوسنتزي فلاونوئيدها از پيش ماده فلاونون¬ها سنتز مي‌شوند. در تحقیق حاضر، بیان دو ژن FNS و LS و یک فاکتور رونویسی WRKY با استفاده از واکنش زنجیره¬ای پلی¬مراز دز زمان واقعی (Real time-PCR) در برگ¬های جوان و ساقه گیاه زیره سبز بررسی شد. در این مطالعه آزمایشی، محرک سالیسیلیک اسید با غلظت¬های 100 میکرو¬مولار و 200 میکرو¬مولار (حل شده در میزان مناسبی آب دوبار تقطیر) با هدف افزایش میزان اسانس، با دو تکرار محلول¬پاشی شد. گیاهان شاهد نیز با حلال مذکور اسپری شدند. نمونه¬برداری از برگ¬های 12 تا 20 روزه هر ساقه و خود ساقه، در زمان¬های 12، 24، 48 و 72 ساعت بعد از محلول¬پاشی انجام شد. نتایج نشان داد که میزان بیان این ژن¬ها می¬تواند تحت تأثیر محرک SA تغییر کند، به ¬نحوی که ميزان بيان ژن FNS و WRKY در هر دو سطح، نسبت به شاهد افزایش، و میزان بیان ژن LS نسبت به شاهد کاهش معنی¬داری نشان داد. بیشترین افزایش بیان ژن¬های FNS و WRKY و بیشترین کاهش ژن LS در 48 ساعت بوده است. با توجه به نتایج حاصل از این تحقیق به نظر می¬رسد که افزایش بیان ژن فلاون سینتاز با توجه به تاثیر سالیسیلیک اسید بر مسیر بیوسنتز ترکیبات دفاعی گیاه مانند فلاونوییدها کاملا" قابل توجیه است. و کاهش بیان ژن لیمونن سینتاز در ساعت های بالاتر،با توجه به اینکه سنتز ليمونن هم در مرحله رونوشت¬برداري و هم پس از آن (ترجمه و بعد ازترجمه) قابل تنظيم است و همچنین با توجه به پيش¬ساز بودن ليمونن براي بسياري از تركيب ها طبیعی به نظر می رسد، البته این امر نیاز به بررسی بیشتری دارد. افزایش بیان ژن WRKY در این بررسی با نتایج تحقیقات قبلی مبنی بر تأثیر سالیسیلیک اسید بر ژن های بالادست مسیر MEP هماهنگی دارد.