پارک ملی و پناهگاه حیات وحش کلاه قاضی بدلیل تنوع وتراکم بالای حیات وحش یکی از مهمترین مناطق محیط زیست ایران به شمار می آید زیستگاه های طبیعی و منابع با ارزش پارک به واسطه ی این کاربری ها و تعارضات در معرض تهدید قرار دارند. شناسایی تعارضات با استفاده از تفسیر تصاویر ماهواره ای وبهره گیری از مطالعات قبلی در این رابطه انجام گرفت. نقشه های مورد نیاز شامل نقشه های تعارضات مورد نیاز شامل نقشه های راه ها، معادن، صنایع، زمین های کشاورزی و مناطق شهری می باشد. نتایج این تحقیق تاثیر انکارناپذیر مداخلات انسانی در اکوسیستم بومی منطقه را تایید می کند. از مهمترین فرایند های تا ثیر گذار بر این روند می توان به عبور اتوبان اصفهان –شهرضا از داخل پارک ملی ، اتوبان کنار گذر شرق اصفهان، مجاورت با کلان شهر اصفهان و تاثیر الودگی ناشی از آن بر منطقه، وجود شهر وروستاهای مجاور منطقه وشهرک های صنعتی حاشیه منطقه اشاره کرد. که بواسطه این فعالیت ها هم کمیت وهم کیفیت منطقه تحت تاثیر قرار می گیرد.