Loading
0 رای
  • آنالیز بیوانفورماتیکی ژن Sre1: ژن کلیدی تنظیم کننده سوخت و ساز چربی ها

  • نویسندگان مقاله
    • فاطمه قناعتیان دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی میکروبی، دانشگاه سمنان، ایران
    • فرشید پروینی استادیار گروه زیست شناسی، پردیس علوم پایه، دانشگاه سمنان، ایران
    • احمد فرهاد طالبی استادیار گروه ژنتیک، دانشکده بیوفناوری، دانشگاه سمنان، سمنان، ایران
  • چکیده مقاله

    SREBP (sterol regulatory element-binding proteins) یکی از فاکتورهای رونویسی اساسی در مسیر تنظیم ساخت چربی است. این فاکتور رونویسی در گونه¬های مخمری با نام SRE1 شناخته می¬شود. . حدود 33 ژن از جمله ژن¬های درگیر در مسیر ساخت چربی¬های خنثی همچون اسیدهای چرب و تری¬گلیسریدها تحت تاثیر این فاکتور رونویسی قرار می-گیرند در پژوهش حاضر به منظور بررسی عناصر متنوع پروموتری ژن Sre1از نرم افزار Gene2promoter و جهت بررسی رابطه تکاملی آن در Schizosaccharomyces pombe نسبت به سایر مخمرها و قارچ¬ها از نرم‌افزارهای ClustalX، GENEDOC و Tree view استفاده شد. آنالیز ناحیه پروموتری ژنSre1، حضور 2 خانواده ماتریسی BZIP و YGAL را نشان داد (P<0.05). از فاکتورهای رونویسی متعلق به این خانواده های ماتریسی می توان به ACA1، ARR1، CIN5، HAC1، YAP1 و SKO1 در BZIP و GAL4 در YGAL اشاره کرد که به ترتیب توسط عوامل فیزیکوشیمیایی مختلفی همچون کربن، آرسنیک، استرس گرمایی، کاهش یون کلسیم، هیدروژن پراکسید، فشار اسمزی و گالاکتوز تحریک شده و باعث افزایش بیان فاکتور رونویسی SER1 و متعاقبا" افزایش بیان ژن¬های مسیر متابولیسم چربی تحت کنترل آن می¬شوند. آنالیز پروموتری مشابه در ژن¬های درگیر در متابولیسم چربی نیز نشان داد که خانواده ماتریسی BZIP در همه آن¬ها مشترک بود. بنابراین، با تحریک این خانواده ماتریسی می¬توان بطور مستقیم و غیر مستقیم باعث افزایش بیان ژن¬های مسیر ساخت چربی شد. بر‌اساس درختچه فیلوژنتیکی حاصل از آنالیز توالی پروتئینی SER1، گونه S.pombe، بیشترین و کمترین شباهت را به‌ترتیب به S. octosporus yfs286 و S. cryophilus OY26 دارد. جالب آنکه، آنالیز اخیر، جز در نواحی کلیدی پروتئین، توالی نه چندان حفاظت‌شده آن را در میان گونه های مطالعه شده نشان داد.

  • کلید واژه

    Sre1، SREBP، مسیر متابولیسم چربی، فاکتور رونویسی، پروموتر، فیلوژنیک

  • راهنمای خرید و دانلود
    • اگر در مجموعه Confpaper عضو نیستید، به راحتی می توانید از طریق دکمه زیر اصل این مقاله را خریداری نمایید .
    • با عضویت در Confpaper می توانید اصل مقالات را با حداقل 20 درصد تخفیف دریافت نمایید .
    • برای عضویت به صفحه ثبت نام مراجعه نمایید .
    • در صورتی که عضو این پایگاه هستید،از قسمت بالای صفحه با نام کاربری خود وارد سایت شوید .
    • لینک دانلود فایل خریداری شده به ایمیل شما ارسال میگردد .
نظرات کاربران

برای ارسال نظر، لطفا وارد حساب کاربری خود شوید.