رودخانه کارون یکی از پر آب‌ترین و طولانی‌ترین رودخانه‌های ایران می‌باشد که به دلیل وجود مراکز متعدد صنعتی و کشاورزی و شهرهای بزرگ در حاشیه‌ی آن موقعیتی ویژه در منطقه غرب و جنوب غرب ایران دارد. در این تحقیق سعی شده است که 20 ایستگاه‌ پایش کیفی آب در مسیر رودخانه کارون به روش الگوریتم ژنتیک بهینه‌سازی شوند. روش الگوریتم ژنتیک شامل دو مرحله آماده سازی داده‌ها و بهینه سازی داده‌ها می‌باشد. در این مطالعه ابتدا حوضه رودخانه به چهار زیر حوضه تقسیم گردید که هر زیر حوضه دارای تعدادی ایستگاه پایش می باشد و امتیاز هر ایستگاه و وزن‌های مورد استفاده در این تحقیق قبلاً توسط محققین دیگر محاسبه و مشخص گردید و این ایستگاه‌ها با توجه به امتیاز خود به صورت تجمعی اولویت بندی گردید. سپس در مرحله بهینه سازی با استفاده از روش الگوریتم ژنتیک 6 ایستگاه‌ که قابل حذف شدن هستند و 14 ایستگاهی که بهینه می باشند مشخص گردید.