گياهان دارويي به دليل داشتن متابوليت هاي ثانويه از اهميت زيادي در علوم پزشكي و داروسازي برخوردار هستند. روش ها و کیت های تجاری متفاوتی براي استخراج RNA از بافت های گیاهی مختلف پیشنهاد شده است استخراج RNA از بافت های گیاهی که سرشار از پلی فنول ها.، کربوهیدرات ومتابوایت های ثانویه می باشند بسیار مشکل است. استخراج RNA .با کیفیت و وضوح بالا برای مطالعات بعدی از قبیل دورگ سازی نورترن، خالص سازی mRNA، واکنش زنجیره ای پلیمرازی (PCR) و ایجاد کتابخانه CDNA ضروری می باشد. در اين تحقيق از چند بافراستخراج RNA در گیاه دارویی بابونه مورد بررسی و ارزیابی قرار گرفت. این بافر ها شامل کیت بایوزول،پی بایوزول و بایوزول به همراه دو ترکیب بتامرکاپتواتانول و پلی ونیل پیرولیدین ((PVP می باشند. در این پژوهش استخراج RNA بوسیله بایوزول به همراه دو ترکیب بتامرکاپتواتانول و پلی-ونیل پیرولیدین (PVP) باعث کاهش شدید اکسیداسیون و استخراج مقادیر مناسب RNA گردید. کمترین میزان RNA و بیشترین سرعت استخراج در استفاده از کیت پی بایوزول مشاهده شد. به منظور تائید کیفیت و خلوص RNA از ژل اگارز یک ونیم درصد استفاده شد. مشاهده RNAهای ریبوزمی و عدم حالت اسمیر روی ژل به عنوان معیاری برای تعیین نمونه ها با کیفیت بالا تلقی گردید.