گیاهان منابع باارزش متابولیت های ثانویه (مواد دارویی، مواد شیمیایی کشاورزی، طعم، بو، رنگ، آفت کش، مواد افزودنی غذایی) هستند. به دلیل تقاضای بالا و تحت تأثیر قرار گرفتن تولید متابولیت های ثانویه توسط بیماری،آب و هوا و نادربودن گیاه، از روش کشت سلولی استفاده می شود. کشت سلولی گیاه جایگزین مناسب کشت کل گیاه برای تولید متابولیت های ثانویه می باشد. در کشت سلول گیاه بایستی مسائلی مانند تجمع سلول، هوادهی و حساسیت برش در نظر گرفته شود. همچنین عناصر محیط کشت و غلظت آن مانند کربن ، فسفر، نیتروژن و فاکتور های محیطی مانند دما، نور، pH برای سنتز متابولیت های موردنظر مؤثر می باشند.