شوري يکي از مهمترين عوامل محدود کننده در بيش از 35 درصد زمين هاي زراعي است. شناسايي ساز و کار هاي مولکولي که در پاسخ گياهان به شوري دخيل است مي تواند به بهبود منابع ژنتيکي در اصلاح گياهان کمک نمايد. نعناع فلفلي يک گياه دارويي و معطر است که ميزان روغن هاي ضروري موجود در آن تحت تاثير عوامل محيطي قرار مي گيرد. تکنيک cDNA-AFLP براي شناسايي برخي ژن هاي افتراقي پاسخ دهنده به تنش شوري در اين گياه به کار گرفته شد. اين آزمايش در قالب طرح کاملا تصادفي با 3 تکرار و سطوح 0، 50، 100، 150 ميلي مول در ليتر NaClانجام پذيرفت. RNA استخراج و رشته اول cDNA با استفاده از آنزيم رونوشت بردار معکوس ساخته شد و رشته دوم از روي رشته اول با استفاده از آنزيم DNA پليمراز ساخته شد. cDNA دو رشته اي با آنزيم هاي برشي PstI و TaqI هضم شد. تکثير اوليه قطعات cDNA برش يافته صورت پذيرفت و تکثير ثانويه با استفاده از آغازگرهاي انتخابي با دو نوکلئوتيد اضافي انجام شد. محصولات PCR روي ژل پلي آکريل آميد 5% جداسازي و باندهاي داراي بيان افتراقي از ژل بريده شده و DNA آن تحت همان شرايط تکثير ثانويه تکثير شد. DNA هاي تکثير شده در باکتري E.coli و با استفاده از کيت کلون جت همسانه سازي و سپس توالي يابي شدند. توالي هاي حاصل با استفاده از BlastX مورد ارزيابي و تحليل قرار گرفت. نتايج نشان داد که ژن هاي جداسازي شده در سه گروه ژني انتقال سيگنال، ژن هاي ساختاري و پروتئين هاي دفاعي گياه طبقه بندي مي شوند.