miRNAها یک رده از RNAهای تنظیم کننده کوچک درون هسته ای و غیرکدکننده پروتئینی بوده که متشکل از حدود ۱۷-۲۲ نوکلئوتید هستند.miRNAها بیان ژن را پس از رونویسی با تجزیه mRNA با مهار ترجمه آن ها کنترل کرده و نقش های متنوعی را در فرآیندهای زیستی (بیولوژیکی) و سوخت و سازی (متابولیکی) در گیاهان بازی می کنند. در این بررسی برای نشان دادن میانکنش بین miRNAها و Transcript Variantهای ژن LOC در گیاه برنج ژاپنی(Oryza sativa Japonica)، پنج نوع Transcript variant ژن LOC موجود در سایت NCBI دانلود شده و با هشت نوع miRNA دسته بندی شده با نرم افزار Clustal Omega مورد استفاده قرار گرفتند، سپس میان¬کنش بین این توالی¬ها (miRNA ها و Transcript variant های ژن LOC) با استفاده از نرم افزار RNAhybrid مورد بررسی و آنالیز شدند. نتایج نشان داد قویترین میان¬کنش بین osa-miR11337-5p با تمامی Transcript variant های ژن LOC و ضعیف¬ترین میان¬کنش بین osa-miR11337-3p با تمامی Transcript variant های ژن LOC برقرار شده است.