-
پیشبینی و بررسی بیوانفورماتیکی توالی ژنی عوامل رونویسی WRKY33، MYB3، ERF15 و MYC2a با استفاده از دادههای ترنسکریپتومی پایگاه داده SRA و TSA در گیاه سرخدار (Taxus baccata L.)
-
- تاریخ انتشار 1401/05/25
- تعداد صفحات 16
- زبان مقاله فارسی
- حجم فایل 961 کیلو بایت
- تعداد مشاهده چکیده 352
- قیمت 29,000 تومان
- تخفیف 0 تومان
- قیمت با احتساب تخفیف: 29,000 تومان
- قیمت برای کاربران عضو سایت: 23,200 تومان
- محل انتشار سیزدهمین همایش ملی گیاهان دارویی وکشاورزی پایدار
-
نویسندگان مقاله
- سیده سمانه عمادی الیردی دانشجوی کارشناسی ارشد گروه ژنتیک و بهنژادی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران
- محمدصادق ثابت دانشیار گروه ژنتیک و بهنژادی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران
- سجاد رشیدی منفرد دانشیار گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران
-
چکیده مقاله
سرطان دومین عامل مرگ و میر در سراسر جهان محسوب میشود؛ هر ساله تقریباً از هر شش مرگ یک مورد بر اثر سرطان است. پاکلیتاکسل (تاکسول) با فعالیت منحصر به فرد در کنترل و درمان بسیاری از انواع سرطانها نقش دارد. پرکاربردترین داروی مورد استفاده در شیمی درمانی سبز پاکلیتاکسل است. درختان جنس Taxus به عنوان منبع طبیعی پاکلیتاکسل اهمیت دارند؛ سرخدار (Taxus baccata L.) از منابع اولیه و طبیعی پاکلیتاکسل است. سادهترین روش دستیابی به پاکلیتاکسل استخراج آن از منابع گیاهی است؛ اما منجر به نابودی منابع طبیعی میگردد. مهندسی متابولیک پتانسیل به دست آوردن مقادیر بیشتر پاکلیتاکسل را دارد. بهبود تولید میزان پاکلیتاکسل ضرورتاً به عمق درک تنظیم مسیر بیوسنتز پاکلیتاکسل بستگی دارد. عوامل رونویسی در سلولهای یوکاریوتی تنظیم رونویسی را بر عهده دارند و با اتصال به عناصر سیس انباشته شدن اجزای بیواکتیو در گیاهان دارویی را افزایش میدهند. عوامل رونویسی از لحاظ اندازه و عملکرد بسیار متنوع هستند؛ اخیراً تعدادی عوامل رونویسی تاثیر گذار در تنظیم رونویسی ژنهای مختلف مسیر بیوسنتزی پاکلیتاکسل از جمله WRKYها، MYBها، AP2/ERFها و bHLHها گزارش شدهاند. در این مطالعه، توالی ژنهای TbWRKY33، TbMYB3، TbERF15 و TbMYC2a در گیاه سرخدار توسط بررسیهای in silico پیشبینی شدند؛ بدین منظور ژنهای مرجع گیاه T. Chinensis در دادههای SRA و TSA گیاه T. baccata جستجو شدند و خوانشهای به دست آمده سرهم بندی شدند تا یک توالی محتمل ساخته شود. سپس توالیهای ژنی توسط نرم افزارهای ORF Finder و MEGA11 و توالیهای پروتئینی توسط پایگاه دمینهای حفاظت شده و Phyre2 آنالیز شدند. نتایج نشان داد به ترتیب ژنهای TbWRKY33، TbMYB3، TbERF15 و TbMYC2a با طول 2421، 885، 1109 و 2112 جفت باز و رمز کننده محصول به طول 733، 237، 337 و 634 اسید آمینه میباشند. نتایج ما به مطالعه تاثیر عوامل رونویسی بر الگوی بیانی ژنها و محصول نهایی مسیر بیوسنتز پاکلیتاکسل در گیاهان دارویی سرخدار کمک میکند.
-
کلید واژه
عوامل رونویسی/ دمین پروتئینی/پاکلیتاکسل/in silico
-
راهنمای خرید و دانلود
- اگر در مجموعه Confpaper عضو نیستید، به راحتی می توانید از طریق دکمه زیر اصل این مقاله را خریداری نمایید .
- با عضویت در Confpaper می توانید اصل مقالات را با حداقل 20 درصد تخفیف دریافت نمایید .
- برای عضویت به صفحه ثبت نام مراجعه نمایید .
- در صورتی که عضو این پایگاه هستید،از قسمت بالای صفحه با نام کاربری خود وارد سایت شوید .
- لینک دانلود فایل خریداری شده به ایمیل شما ارسال میگردد .
نظرات کاربران
برای ارسال نظر، لطفا وارد حساب کاربری خود شوید.