نظام بودجه ریزی عملیاتی یکی دیگر از تحولاتی است که در نظامهای بودجه بندی دولتها و بخش عمومی مورد توجه قرار گرفته است . این نظام بودجه بندی با تاکید بر روی نتایج، کارایی و اثربخشی، زمینه بهبود پاسخگویی مقامات دولتی را در قبال شهروندان فراهم آورده و امکان تخصیص بهینه منابع را ایجاد م ینماید. در ایران، در یک دهه گذشته برای بهبود بودجه ریزی و پاسخگویی، تدوین بودجه عملیاتی الزامی و پس از آن، حسابرسی عملیاتی با توجه به بودجه عملیاتی در سالهای اخیرپیگیری شده است. به نظر می رسد برای تکمیل اقدامات انجام شده تغییرسیستم حسابداری دولتی از نقدی به تعهدی ضرورت داشته باشد. حسابداری تعهدی، وضع موجود واحد گزارشگررا بهتر توصیف می کند و معیارهای حسابرسی کارکرد را بهبود می بخشد. بکارگیری حسابداری تعهدی موجب تهیه اطلاعات سودمندتر برای بهبود تخصیص منابع، افزایش پاسخگویی، افزایش شفافیت اطلاعاتی و ایجاد آگاهی نسبت به اثرات اقتصادی می شود.برای حسابرسی عملیاتی، توصیف وضع موجود واحد گزارشگر ومعیارهای ارزیابی حسابرس از اهمیتی اساسی برخوردار است. از این رو، اصلاح نظام بودجه وحرکت از سیستم حسابداری نقدی به سیستم حسابداری تعهدی بعنوان راهکارهای زمینه ساز حسابرسی عملیاتی مد نظر قرار گرفته است