لكه برگي و بلايت آلترناريايي ناشي از گونه‌های شبه جنس قارچ .Alternaria spp يكي از عموميترين و شايعترين بيماريهاي مهم در مناطق پنبه‌خیز جهان ميباشد. در ايران نيز بيماري لكه برگي در تمام نقاط كشور شايع بوده ولي شدت بيماري در استان‌های گلستان، مازندران، اردبيل و برخي مناطق استان‌های فارس و خراسان كه از شرايط مرطوب و خنك در اول و آخر فصل رشد پنبه برخوردار هـستند، بيشتر ميباشد. لکه‌ها به رنگ قهوه‌ای تيره يا سياه بوده و به مقدار زياد و گاهي پيوسته به‌صورت دواير متحدالمركز و به حالت موجي شكل مشاهده می‌شوند. این تحقیق باهدف شناسایی گونه‌هاي قارچی عوامل لکه برگی پنبه در استان گلستان با استفاده از داده‌های ریخت شناختی انجام شد. برای این منظور از مناطق مختلف پنبه‌کاری استان گلستان در ماه‌های خرداد و تیرماه نمونه‌برداری صورت گرفت. پس از جداسازي قارچ‌هاي عامل بیماري، خالص‌سازي به روش تک اسپور و نوك ریسه انجام شد. شناسایی جدایه‌هاي قارچی در سطح گونه با بررسی‌هاي ریخت شناختی صورت گرفت. نتایج این بررسی نشان داد گونه Alternaria alternata با فراوانی بسیار بالا به‌عنوان گونه غالب در ایجاد لکه برگی در مراحل گیاهچه پنبه می‌باشد.