حفظ موجودات مفید خاکزی به منظور کاهش عوامل بیماری زای گیاهی امر بسیار مهمی است. نتایج زیانبار این مواد شیمیایی با تولیدات مخرب بر محیط زیست و سلامتی انسان، ضرورت یافتن راه های جدید و بی خطر برای کنترل بیماری ها را نشان می دهد. بنابراین یک توانایی ذاتی و بیولوژیکی که بتواند پایداری یا ماندگاری را به خوبی مقاومت اکتسابی برای حفاظت گیاهان از بیماری ها بالا ببرد مورد نیاز است. قارچ میکوریزا آربوسکولار یکی از مواردی است که می تواند این توانایی را در گیاه ایجاد کند. ارتباط دوطرفه این قارچ ها و گیاهان می تواند باعث افزایش سلامت گیاهان و غلبه بر تنش های زنده و غیر زنده شود. قارچ های میکوریزا آربوسکولار، همزیست ریشه 80 درصد گیاهان، از جمله اغلب گیاهان زراعی و درختان میوه هستند. آنها ضمن استقرار درون بافت ریشه و تولید آربوسکولار درون سلول های پوست داخلی آن، شبکه ظریف ریسه های خارج ریشه ای نیز تولید می کنند. این قارچ ها با افزایش جذب آب و عناصر غذایی برای گیاهان، تغییر در مواد شیمیایی بافت های گیاهی، رقابت با بیمارگرها برای محل استقرار و مواد غذایی، تغییر در ساختار ریشه، کاستن از تنش های محیطی و افزایش جمعیت باکتری های مفید خاک به مدیریت بیماری های قارچی، شبه قارچی، نماتدی، باکتریایی و فیتوپلاسمایی گیاهان کمک می کنند. جمع آوری، شناسایی، خالص سازی، تکثیر و تلقیح این قارچ ها به گیاهان می تواند مصرف کودها و سموم شیمیایی را که خطرات بسیاری برای محیط زیست و مصرف کنندگان محصولات کشاورزی و باغی دارند کاهش دهند.