MAS اصطلاح گیاه به واسطه انتخاب به کمک نشانگر است که با کمک توالی یا الگوی باندی حاصل از نشانگرهای مولکولی که در اطراف ژن مورد نظر قرار گرفته اند می توان به طور غیر مستقیم حضور یا عدم حضور صفت مورد نظر را بررسی کرد. پژوهش حاضر به منظور تعیین ژنوتیپ 100 بوته در حال تفکیک 2F برنج بر اساس نشانگر مولکولی کیفیت در دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری در سال 1393 انجام گرفت. در تحقیق حاضر با استفاده از RM190 در یافتیم که از بین 100 بوته برتر انتخابی32 بوته دارای ژن هتروزیگوس در مکان ژنی آمیلوز، قوام ژل و دمای ژلاتینه شدن بوده است. نشانگر RM190 ارقام کیفی در جمیت های 5 (هاشمی/ نعمت)، 6( سنگ طارم/ نعمت) ، 7(طارم دیلمانی/ نعمت) و 8 (جلودار/ نعمت) را از سایر جمعیت ها کاملا متمایز کرد. برای بررسی رسیدن به لاین خالص جدید با ویژگی موثر در صفات کیفی پخت می بایست بوته های انتخابی را برای رسیدن به لاین های خالص در نسل های پیشرفته تر مورد بررسی قرار داد.