نشانگر مولکولی جدید TRAP(Target Region Amplification Polymorphism) برای اولین بار در آفتابگردان در سال 2003 کشف شد. در این نشانگر از یک آغازگر ثابت طراحی شده برای توالی بیان شده برچسب‌دار (Expressed Sequence Tag-EST) و یک آغازگر تصادفی برای ایجاد نشانگر چندشکل در اطراف توالی‌های ژن کاندیدای هدف استفاده می‌شود. این نشانگر بین 30-50 قطعه چندشکل ایجاد می‌کند و به این دلیل جزو نشانگرهای با درجه چندشکلی بالا به‌شمار می‌رود. با وجود 12 سال از معرفی این نشانگر هنوز گزارشی در مورد استفاده از آن برای ارزیابی تنوع ژنتیکی در آفتابگردان و حتی سایر گیاهان در کشور وجود ندارد. از طرف دیگر در بسیاری از آنالیزهای مولکولی نظیر نشانگرهای مولکولی و انگشت¬نگاری ژنتیکی ژنوتیپ¬ها، تعداد زیاد نمونه¬های آزمایشی باعث دشواری کار و صرف هزینه ساخت ژل¬های متعدد و همچنین صرف زمان زیاد برای انجام آزمایش می¬باشد. در این تحقیق برای بررسی تنوع ژنتیکی با استفاده از نشانگر TRAP از روش جدید الکتروفورز ژل پلی¬اکریلامید با استفاده از رنگ¬آمیزی اتیدیوم¬بروماید استفاده شده که نسبت به روشهای رنگ¬آمیزی نقره و نشاندارکردن آغازگرها با فلورسنت، دارای مزیتهایی همچون مقرون به صرفه بودن، سرعت بالای آنالیز، حجم بالای 196 نمونه¬ای در هر آزمایش و همچنین استفاده مجدد از ژل¬ها می¬باشد. نتایج نشان داد که 19 ترکیب آغازگری در مجموع 116 باند ایجاد کردند که 109 تای آنها چند شکل بود. محتوای اطلاعات چندشکل این نشانگر بین 03/0 و 5/0 و میانگین 33/0 نشان داد که به عنوان یک نشانگر قدرتمند با چندشکلی بالا می‌تواند در بررسی تنوع ژنتیکی ژرم‌پلاسم آفتابگردان مورد استفاده قرار گیرد.