مسئله جدا سازی اجزا یا قطعات مشابه از یکدیگر و چیدمان جعبه ها درون کانتینرها یکی از مسائل مهم در کارخانجات صنعتی و تجارت می باشد که نیاز به نیروی انسانی و زمان زیادی دارد . مسئله جایگذاری ، حالت خاصی از مسئله بسته بندی بهینه است که هدف یافتن ترتیب خوبی از چیدمان جعبه ها در ناحیه های بزرگ (سطل ، کانتینر ، تخته و غیره) می باشد. گاهی اوقات در این چیدمان ناهمگنی هایی وجود دارد که از جمله آن می توان به قرار گرفتن اشیاء خاص در کنار هم و تجمع وزن بالا در یک ناحیه خاص اشاره کرد. ما در این مقاله حالت خاصی از قرار گیری جعبه ها درون کانتینر را در نظر گرفته ایم که در آن با فرض برابر بودن اندازه جعبه ها ، از 8 رنگ مختلف برای جدا سازی جعبه ها از هم استفاده کرده ایم. با استفاده از الگوریتم ژنتیک پیشنهادی به چیدمان همگنی از جعبه ها رسیده ایم که در آن هیچ دو جعبه ی مشابه و هم رنگی از لحاظ سطری ، ستونی و قطری در کنار هم قرار ندارند. نتایج حاصل از اجرای الگوریتم را در نرم افزار متلب با دو جمعیت اولیه 50 و 100 و دو سایز ماتریس مختلف که بیانگر سایز کانتینر های مختلف است با هم مقایسه و تصویر سازی 3 بعدی آن را نیز ارائه نموده ایم.