به منظور طراحي هرچه دقيق¬تر و قدم برداشتن در جهت طراحی سیستم کنترل سلول های سوختی شناخت صحيح پاسخ تولیدی الکتریسیته در مقابل پارامتر¬های جریان ورودی و خروجی از اهميت بسزايي برخوردار است. این مطالعه در نظر دارد تا با از انتخاب یک مدل تجربی معتبر و شبیه سازی کارکرد سلول سوختی کربنات مذاب به منظور گام برداشتن در جهت مدلسازی نهایی و بررسی تاثیر پارامتر¬های ورودی نظیر فشار کارپیل، جهت حرکت سیال در کانال ها، دبی، دما، غلظت CO2،H2O و... در ورودی جریان (که از مهمترین مباحث در جهت طراحی کنترلر است) بر سلول سوختی کربنات مذاب بپردازد. در این راستا از نرم افزارCOMSOL Multiphysics به عنوان ابزار مدلسازی بهره گرفته شده است. در این مطالعه شبیه سازی عددی سلول سوختی کربنات مذاب (MCFC) ارائه شده و مدل فیزیکی شامل الکتریکی، الکتروشیمیایی، انتقال جرم و بقای ممنتوم مورد تحلیل قرار گرفته است. تغییرمتغیرها در سلول به طور مستقیم توسط فرمول های مربوط به ریاضی اعمال شده. در ادامه نتایج زیر ارائه میگردد: افزایش غلظت O2 در کاتد باعث افزایش توان خروجی پیل می شود. چگالی جریان و توان خروجی پیل سوختی در حالت جریان غیر هم جهت در فشارهای مختلف با توجه کسر جرمی ارائه شده اثر بسزایی بر افزایش جریان خروجی پیل خواهد داشت. این نتایج حاصل تغییر در مقادیر پارامترهای موثری همچون غلظت، جهت جریان و فشارکاری در شبیه سازی پیل سوختی می باشد که قابلیت بهینه سازی و استفاده به عنوان ورودی برای ساخت یک کنترلر پیل سوختی کاربرد خواهند داشت.