گل بنفشه معطر دارای ارزش‌ زینتی و اقتصادی بالایی در صنعت گل‌کاری و عطر‌سازی است. هدف از مطالعه حاضر تعیین مسیرهای ژنتیکی و بیوشیمیایی دخیل در سنتز رایحه‌ گل در بنفشه معطر بود. داده‌های اولیه EST گیاه از پایگاه‌داده دانشگاه هاروارد بازیابی شد. توالی‌های EST با استفاده از نرم‌افزار EGassembler به کانتیگ‌ها‌ و سینگلتن‌ها سرهمبندی شده و توسط X-blast نرم‌افزار CLCbio در برابر پایگاه‌داده پروتئین غیر تکراری بررسی شدند. توالی‌های پروتئینی با اصطلاحات هستی‌شناسی ژن (GO) نگاشت شدند و با استفاده از وب‌سرور PANNZER2 به سه دسته تفسیر شدند. تحلیل غنی‌سازی GO توسط WEGO با آزمون χ2، با استفاده از کل پروتئوم به عنوان گروه مرجع انجام شد. نگاشت پروتئین‌های متناظر به مسیرهای KEGG با استفاده از سرور KAAS v2.0 نماینده‌ترین مسیرها را نشان داد. 71/48 ٪ یونیژن‌ها به مسیرهای KEGG اختصاص داده شد و 51 یونیژن به چهار گروه متابولیسم و ده مسیر دخیل در سنتز رایحه‌ گل شامل متابولیسم کربن اولیه، ایزوپرنوئیدها، امینواسیدها و اسیدهای چرب تخصیص داده شد. نتایج تحلیل مسیر، آنزیم‌های مرتبط با بیوسنتز مونوترپن‌های لیمونن، لینالول، ژرانیول، لینالیل استات، سیترونلال و ترپن‌های غیر معمول β-α یونون، سولکاتون و α-یونول را در متابولیسم ایزوپرنوئیدها، سنتز متیل سالیسیلات و بنزنوئیدهایی مانند بنزالدئید را در متابولیسم امینواسیدها و سنتز ترکیبات فرار برگ سبز از جمله نونانال، هگزنال، اکتانال و اندیکین را در متابولیسم اسیدهای چرب شناسایی کرد. بنابراین نتایج، می‌توان رویکرد مهندسی متابولیک با افزایش شار کربن از متابولیسم اولیه به سمت متابولیت‌های ثانویه در بیوسنتز متابولیت‌های تخصصی و افزایش رایحه گل‌ها را ممکن ساخت.