آرسنات و فسفات آنالوگ یکدیگر هستند و از طریق حامل¬های مشترکی توسط ریشه جذب ¬می¬شوند. آرسنیک جزء عناصر سمی برای گیاه محسوب می¬شود که معمولاً نقش محدود کننده¬اي در رشد و نمو آن دارد. در این تحقیق به منظور بررسی اثر آلودگی آرسنیک بر برخی خصوصیات بیوشیمیایی گیاه سویا، آزمایشی به صورت فاکتوریل 2×2×4 در قالب طرح کاملاً تصادفی با 3 تکرار در گلخانه پژوهشکده کشاورزی هسته¬ای در سال 92- 93 اجرا شد. عامل اول گیاه سویا در دو سطح رقم مادری L17 و لاین امید بخش حاصل از آن، عامل دوم تیمار آلودگی آرسنیک در دو سطح mg.kg-1 0 و 10 و عامل سوم سطوح فسفر شامل mg.kg-1 0، 25، 50 و 100 بود. مقادیر فسفر و آرسنیک به ترتیب از طریق نمک¬های دی¬پتاسیم¬هیدروژن¬فسفات و دی¬سدیم-هیدروژن¬آرسنات به خاک اضافه گردید. نتایج این تحقیق نشان داد؛ آرسنیک در خاک سبب افزایش کاتالاز (05/0 ≤P) و کاهش مالون دی¬آلدهید اندام¬هوایی (01/0 ≥P) گردید. نتایج اثرات متقابل نشان داد؛ افزودن فسفر به خاک آلوده سبب افزایش فعالیت کاتالاز (05/0 ≥P) و کاهش تولید مالون¬دی¬آلدهید (05/0 ≥P) شد. براساس نتایج بدست آمده؛ اگرچه بین گیاه مادری سویا و لاین امید بخش حاصل از آن از نظر میزان مالون¬دی¬آلدهید تولید شده در اندام¬هوایی تفاوت معنی داری وجود نداشت اما اثر متقابل رقم و آرسنیک از نظر این صفت معنی¬دار بود.