سرخارگل با نام علمی Echinaceae purpurea ، گیاهی دارویی دارای ترکیبات فنلی حلقوی و اسانس بوده، این ترکیبات فنولی در گیاهان از فنیل آلانین وتریوزین مشتق شدهاند. آنزیم فنیل آلانین آمونیا لیاز PAL یکی از مهمترین آنزیمها در مسیر فنیل پروپانوئیدها میباشد. بیان ژن PAL در طیف وسیعی از محرکها شامل دماهای بالا، هورمونها، اشعه فرابنفش و سایر شرایط تنشی افزایش مییابد. در این تحقیق تغییرات بیان ژن و فعالیت آنزیم PAL در بافت ریشه و برگ 120 روزه گیاه سرخارگل تحت 3 تیمار (سالسسیلیک اسید 2 میلیمولار، متیل جاسمونات 200 میکرومولار و غلظت صفر) و 4 زمان ( صفر ، 12 ، 24 و 48 ساعت) انجام شد. پس از استخراج RNA اقدام به سنتز cDNA شد و توسط واکنش Real Time PCR با استفاده از SYBERGreen و روش مقایسه ای ΔΔCt بیان ژن مورد مطالعه قرار گرفت. و از نرم افزار SAS جهت آنالیز دادهها استفاده شد. نتایج نشان داد که اثر متقابل دو فاکتور زمان و غلظت محرک برای بیان ژن و فعالیت آنزیم PAL در ریشه و فعالیت آنزیم PAL در برگ در سطح احتمال 1 درصد معنی دار است. و تیمار متیل جاسمونات 200 میکرومولار و سالیسیلیک اسید 2 میلیمولار باعث افزایش معنیدار بیان ژن و فعالیت آنزیم PAL با گذشت 12 ساعت بعد از تیمار دهی در ریشه و همچنین افزایش فعالیت آنزیم PAL در برگ میگردد. این افزایش بیان و فعالیت آنزیم PAL در زمان 48 ساعت و با تیمار سالسسیلیک اسید 2 میلیمولار بیشترین مقدار را نشان داد. باتوجه به معنیدار نبودن اثر متقابل بین زمان و غلظت محرک برای بیان ژن در برگ، از هر فاکتور به عنوان فاکتور اصلی برای مقایسه میانگین سطوح مختلف هر فاکتور استفاده شد. و نتایج نشان داد که تیمار متیل جاسمونات و سالیسیلیک اسید به عنوان فاکتور غلظت در برگ بر بیان ژن PAL افزایش معنیداری نداشته ولی بیان آن در طول زمان افزایش معنیداری پیدا کرد که با افزایش معنیدار فعالیت آنزیم فنیل آلانین آمونیالیاز پس از 24 ساعت تیمار هماهنگ بود.