هدف از این مطالعه ارزیابی غلظت سرب و مس در آب و رسوب رودخانه چشمه‎علی و همچنین بررسی تأثیر عوامل زمین‎زاد و بشرزاد بر روند تغییرات این فلزات در رودخانه می‎باشد. برای تعیین آلودگی فلزات سنگین (سرب و مس)، نمونه‎های آب و رسوب از 24 ایستگاه در امتداد رودخانه چشمه‎علی (از مظهر چشمه تا سد شاهچراغی)، سرشاخه دامغانرود و آستانه در پایان فصل خشک برداشت شد. غلظت مس و سرب توسط دستگاه جذب اتمی اندازه‎گیری گردید. غلظت مس نمونه‌های آب در تمامی ایستگاه‎ها پایین‎تر از حدمجاز استاندارد آب آشامیدنی (2011 WHO) می‎باشد. به‌دلیلpH قلیایی منطقه، سرب در نمونه‌های آب ردیابی نگردید. غلظت مس رسوبات بین 9/5 تا mg/Kg 6/15 و سرب بین 12تا mg/Kg 36 تغییر می‌کند. کمترین تمرکز فلزات سنگین در رسوبات در ایستگاه‌های ابتدائی به دلیل تأثیر بسزای رخنمون سازند کربناته اندازه‌گیری شد. مقادیر شاخص زمین انباشت و فاکتور الودگی در رسوبات برای عنصر مس، در محدوده غیر آلوده قرار می گیرد. مقادیر فاکتور غنی‌شدگی برای سرب در رسوبات، آلودگی اندک تا قابل توجه به سرب در منطقه را نشان می دهد. این فلز به طور عمده از لایه زغالدار سازند شمشک در منطقه و فعالیت‌های کشاورزی در حاشیه رودخانه سرچشمه می‌گیرد.