هنگامی که بحث سازه های آبی و محیط زیست مطرح است، عاملی که موجب دگرگونی محیط زیست می شود، سد است، سد گتوند عليا با 182 متر ارتفاع، بلندترين سد خاكي كشور می باشد یکی از مهم ترین اثرات زیست محیطی این سد شوری ایجاد شده توسط معدن نمکی که در مخزن این سد وجود داشت می باشد که بعد از آبگیری این معدن به کلی زیر آب فرو رفت و شوری آب رودخانه کارون به بالاترین حد ممکن رسید که این مقدار شوری بر کیفیت آب پایین دست بیشترین تاثیر را دارا می باشد بطوریکه مصارف کشاورزی و شرب و حیات آبزیان و... به شدت تحت تاثیر این پارامتر است. در این مقاله با استفاده از مدل عددی MIKE11 مقدار شوری ازایستگاه سد گتوند تا اهواز شبیه سازی شده و مقدار شوری آب رودخانه در ایستگاه اهواز در زمانهای مختلف تعیین شد، نتایج نشان داد در اکثر زمان ها در بازه زمانی شبیه سازی شده مقدار غلظت شوری بیشتر از 1 PSU می باشد لذا می توان با توجه به نتایج شبیه سازی شده توسط مدل، مقدار شوری تخلیه شده از خروجی های سد گتوند را مدیریت کرد تا اثرات زیست محیطی آن بر پایین دست تا حدی کاهش یابد.