یکی از فنآوری های سبز برای پالایش انواع آلاینده های آلی و معدنی، گیاه پالایی است. درختان به عنوان یکی از مهمترین گیاهان عالی می توانند در فرایند گیاه پالایی نقش مهمی ایفا کنند. مکانیسم هایی مانند تولید چوب، تولید ریشه های عمیق و گسترده، تولید زیتوده و دارا بودن نرخ بالای تبخیر و تعرق، درختان را به عنوان یک ارگانیسم موثر در پالایش آلاینده ها مطرح می کند. درختان سربیع الرشد و دارای تولید زیتوده ی بالا، توان انباشت آلاینده های غیرآلی و فلزات سنگین را در بخش های روزمینی خود دارا هستند. اما در پالایش ترکیبات آلی، توان درختان به دلیل وجود ترکیبات آب گریز کاهش یافته و آنها بیشتر در حالت محلول اقدام به جذب این آلاینده ها می کنند. به دلیل سمیت بالای آلاینده های مختلف، درختان دارای مکانیسم هایی برای زیست دگرگونی ترکیبات آلی آب گریز به آب دوست، و استفاده از پروتیین هایی مانند فیتوکلاتین ها و متالوتیونین برای سمیت زدایی آلاینده های غیرآلی هستند.