قارچ¬های اندوفیت موجوداتی هستند که در گیاهان زنده یافت می¬شوند و بخشی از زندگی خود را بدون ایجاد هیچگونه علائم بیماری¬زایی در گیاه سپری می¬کنند. قارچ¬های اندوفیت در اکثر گیاهان وجود دارند. گیاهان دارویی یک منبع ارزشمند برای زندگی قارچ¬های اندوفیت هستند و قرن¬هاست که به عنوان دارو استفاده می¬شوند. امروزه با توجه به گسترش بیماری¬های کشنده استفاده از گیاهان دارویی به عنوان یک امر ضروری شناخته می¬شود. قارچ¬های اندوفیت نقش موثری در تولید متابولیت¬های فعال زیستی مانند ترپنوئید¬ها، استروئید¬ها، کینون¬ها، فنل¬ها و کومارین¬ها دارند. اندوفیت¬ها نقش مخازن شیمیایی در گیاهان دارویی دارند و با تولید ترکیبات ضد سرطان، تنظیم کننده سیستم ایمنی، آنتی اکسیدان، ضد انگل، ضد ویروس، ضد سل و بعنوان حشره¬کش نقش موثری در صنایع کشاورزی و داروسازی ایفا می¬کنند.