صنعت و فعالیت های معدن کاری با به جای گذاشتن میراثی چون آلاینده های زیستی و تنزل کیفیت خاک های مناطق معدن کاری، سلامت محیط زیست را به خطر آلودگی دچار کرده و چهره زشتی را به مناطق آلوده شده می دهد، به خصوص در نواحی که فعالیت های معادن فلزی از جمله سنگ شکنی، آسیاب کردن، فرآوری، ذوب کردن، مشغول به کار باشند منجر به تولید مقدار زیادی باطله می شود. مواد باطله که در اطراف معادن انباشته می شوند حاوی مواد واکنش دهنده ای می باشد که تمایل به اکسید شدن در حضور اکسیژن محیط، آزادسازی فلزات سمی و تولید اسید دارند و همه این موارد، منبعی از مواد آلاینده برای محیط زیست از جمله آلودگی آبهای زیر زمینی منطقه، قلمداد می شوند. بمنظور تعیین کیفیت آب های زیرزمینی در محدوده مجتمع معدنی آهن ابرکوه، از 4 ایستگاه آب های سطحی و 2 ایستگاه آب های زیرزمینی نمونهبرداری شد که برای اندازه گیری عوانلی مانند نیترات، سولفات، کلسیوم، روی، آهن، سرب، کروم و غیره، از روش هایی مانند اسپکتروفتومتری، جذب اتمی، گراویمتری و غیره استفاده شد که نتایج نشان داد نیترات با میانگین غلظت 17/81؛ فسفات 18/77؛ منیزیوم 325؛ کلسیوم 28/13 دارای بیشترین غلظت در منطقه می باشند که این عوامل می توانند تاثبر بسیاری بر روی کیفیت آبهای زیر زمینی منطقه بگذارند.که برای جلوگیری از این اثرات نا مطلوب روش هایی مانند گیاه پالایی که می توانند تاثیر زیادی بر روی کاهش آلودگی های ناشی از سدهای باطله داشته باشد، پیشنهاد می شود به دین ترتیب که هر گیاه بنا به خصوصیات منطقه و نوع ماده آلاینده در منطقه مورد استفاده قرار می گیرد.