رودخانه کارون و شاخه های آب به عنوان شاهرگ حیاتی استان خوزستان از اهمیت ویژ] ای برخوردار است. این رودخانه پس از رسیدن به شهر تاریخی شوشتر در محلی به نام بند میزان به دو شاخه مهم تقسیم می شود (شاخه گرگر و شطیط) رودخانه گرگر یکی از شاخه های مهم رودخانه کارون بوده که در ابتدای شهر شوشتر از کارون جدا شده و پس از طی مسافتی 78 کیلومتری و دریافت مازاد آب اراضی کشاورزی و زهکش های پرورش ماهی مجددا به کارون می پیوندد به دلیل حجم کم آبگذر این رودخانه و حجم بالای زه آب های تخلیه شده به آن در اکثرم واقع خصوصا فصول کم آبی، مصرف کنندگان ناچارند از آبی با شوری بالا و طعم و بوی نامناسب استفاده کنند هدف کلی از این مطالعه بررسی و مقایسه پارامترهای کیفی آب بر اساس تجزیه و تحلیل نتایج حاصل از نمونه برداری از پنج ایستگاه مختلف بر روی رودخانه گرگر از بند میزان تا انتهای گرگر به مدت هفت ماه از فروردین تا مهر ماه سال 1392 انجام گردیده است پارامترهایم ورد بررسی شامل شش پارامتر مهم فیزیکی و شیمیایی آب که عبارتند از DO، BOD5، COD ، فسفات و کلرور و نیترات می باشند جهت تعیین وضعیت کیفی آب رودخانه گرگر در جهت مصارف آب شرب، کشاورزی و صنعت در قیاس با استانداردهای جهانی مورد ارزیابی انجام گردید. نتایج حاصله به کمک نرم افزار Excel مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفته و نشان می دهد که میزان اکسیژن محلول در قیاس با استاندارد ها بیشتر، BOD5 تقریبا برابر و سایر موارد یعنی پارامترهای COD، فسفات، کلرور و نیترات کمتر می باشد که می توان به میزان مواد آلاینده خروجی از منابع اشاره نمود.