بابونه Matricaria recutita L. از تیره کاسنی، یکی از گیاهان دارویی مهم است که در طب سنتی و جدید مورد استفاده قرار می گیرد. شوري یکی از فاکتور هاي مهم بوم شناختی است که پایداري مناطق خشک و نیمه خشک به ویژه مناطقی که تبخیر و تعرق بیش تر از میزان بارندگی است را تهدید می کند. این پژوهش به منظور بررسی ترکیبات بیوشیمیایی در سه ژنوتیپ برتر بابونه تحت اثر سطوح مختلف شوری در مزرعه مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی اصفهان به صورت اسپیلت پلات در قالب طرح بلوک های کامل تصادفی با سه تکرار و دو فاکتور شوری و ژنوتیپ طی سال زراعی 92-91 اجرا گردید. فاکتور اصلی شامل سطوح شوری شاهد، 6، 9 و 12 دسی زیمنس بر متر و فاکتور فرعی شامل ژنوتیپ های اصفهان، اهواز و شیراز بود. با توجه به نتایج بدست آمده، ترکیبات جذب کننده UV و درصد نشت یونی معنی دار نشدند. نتایج نشان داد که این گیاه در برابر تنش شوری مقاوم بوده و در میزان ترکیبات بیوشیمیایی آن اختلاف معنی داری در سه ژنوتیپ مورد بررسی تحت اثر تیمارهای مورد نظر مشاهده نشد. لذا می توان از این گیاه در مناطق با آب آبیاری شور (تا 12 دسی زیمنس بر متر) استفاده کرد.