این تحقیق به منظور شناسائی ارقام مختلف دیپلوئید و الو تتراپلوئید پنبه در مدت یک سال انجام گردید.پس از انجام الكتروفورز عمودي پروتئين‌هاي دانه ارقام مورد مطالعه، مجموعاً 31 موقعيت براي تشكيل نوارهاي پروتئين تشخيص داده شد. ميانگين تعداد نوارهاي تشكيل شده براي هر گونه متفاوت بود و در داخل هر گونه، ارقام داراي نوارهاي متفاوتي بودند. بين ارقام گونه‌هاي ديپلوئيد دنياي قديم تفاوت قابل ملاحظه‌اي از نظر تعداد نوارها و ميانگين نوارها مشاهده گرديد. بطوري كه ميانگين تعداد نوارها در ارقام گونة G.herbaceum ، 25 نوار و در گونه G.arboreum ، 20 نوار بود. چنين تفاوتي بين ارقام گونه‌هاي الوتتراپلوئيد نيز به وضوح ديده شد. بطوري كه ميانگين تعداد نوارها در ارقام گونه G.barbadense ، 21 نوار و در گونه G.hirsutum ، 17 نوار بود در ميان ارقام ديپلوئيد دنياي قديم، رقم بنفش كرمان بيشترين نوار(27 نوار) و رقم ايران-1 كمترين نوار (15 نوار) را به خود اختصاص دادند.