زمینه و هدف: هدف از پژوهش حاضر، بررسی تاثیر تمرین تناوبی شدید (HIIT) بر سطوح سرمی عامل نوروتروفیک مشتق از مغز (BDNF) و ترکیب بدنی پسران جوان غیر فعال بود.روش کار: در این پژوهش نیمه تجربی 16 نفر از دانشجویان پسر غیر ورزشکار دانشگاه سیستان و بلوچستان، در 2 گروه مساوی 8 تایی (کنترل و تمرین) به طور تصادفی تقسیم شدند. گروه تمرین، تحت تمرین تناوبی شدید از نوع HIIT به مدت 6 هفته که همان پروتکل تمرینی شاتل ران که در یک مسافت 20 متری به صورت رفت و برگشت به مدت 30 ثانیه با شدت 90 درصد ضربان قلب حداکثر و 30 ثانیه استراحت فعال بین هر تکرار انجام گرفت. گروه کنترل طی این 6 هفته پژوهش هیچ گونه مکمل و دارویی مصرف نکردند، همچنین هیچ فعالیت ورزشی انجام ندادند. مقادیر BDNF با روش الایزا سنجیده شد و داده ها با استفاده از آزمون تی مستقل وتی همبسته در سطح 05/0≤ p تحلیل شدند.یافته ها: در پژوهش حاضر یافته ها نشان دادند، مقادیر سرمی BDNF پس از 6 هفته، در گروه تمرین HIIT نسبت به گروه کنترل افزایش معنی داری (031/0=p)، وزن (008/0=p) و شاخص توده بدنی (005/0=p) کاهش معنی داری داشتند.نتیجه گیری: با توجه به پارامترهای حاصل از مطالعه به نظر می رسد، تمرین ورزشی تناوبی شدید می تواند با کاهش وزن و BMI سبب افزایش سطوح سرمی BDNF دانشجویان پسر غیر فعال شود.